1，南京大学。南大作为全国一流学府，当之 无愧是南京老大。
2，东南大学。中央大学的主要继承者，瘦死的骆驼经比马大，何况东大在吃了铁医之后，实力更和南理工南航拉开了一截。
3，南京航空航天大学。南京航空学院和北京航空学院一样都曾为国家作出过特殊的贡献，国家自然也不会亏待他们。美国佬野蛮轰炸我驻南使馆之后，南航更是马上得到了八千万做为发展基金。靠着这笔钱，南航财大气粗的抛出了全国最高的入学奖学金。
4，南京理工大学。炮兵工程学院靠着国家足够的投入，其实力一直在增长。只是其学风好象不是工科院校：学校有点像个集市，而夏天打赤膊的男生更不少见。
5，河海大学。虽然其学校一直在走下坡路，但昔日的华东水利学院实力仍不可小视，在水利方面仍是老大。
6，南京农业大学。虽然是冷门，但南农在其领地实在是太强了，可以和中国农业大学比高低。
7，南京师范大学。本来跟本成不了气候，但靠着江苏省九五期间重点建设的东风，使其学校发展壮大起来，马上的金陵大学会成为一所比较完备的综合性大学。
8，南京工业大学。南京化工大学和南京建筑工程学院就其本来而言不过如此，但两校一合并成为江苏省十五期间建设的重点学校，加上南化出了一个学术上的牛人，前途不可小视。
9，中国药科大学。本来其实力不强，但由于医药业的高利润和生物制药的热门使其开始发标。
10，南京邮电学院。把南邮排在这里会不会糟到南邮学生的痛骂，但南邮做为一所大学只有一幢主楼的现实和学术上的先天不足：没有院士没有博士点，和其专业设置上面的狭窄其排名难以提高，其学生的目空一切与就业的短视（只往单位，赚钱的多的地方跑，不往学术机构跑）使其学术氛围更加不够。虽然如此，南邮有着南京第二的生源（仅次于南大）和专业热门的优势以及传统的良好的学风，做为学生自己而言，成为南邮人仍为一种很理想的选择。
11，南京林业大学。南林大一样是冷门，虽然有者很强的实力但不能和南农大相提并论。
12，南京经济学院。南京财经大学只不过是未来的事情，但专业都还好，还有潜力。
13，南京气象学院。把南气排在这边并不是她不行，只不过她的规模太小和专业性太强。其实南气受到的重视程度应该是很高的。就业也很好。应该发展规模，另外，把名字改掉。
14，南京审计学院。南审排在最后应该是很冤的，应该她是全国审计系统唯一的高校。是国家审计总署的掌上明珠，就业和南气一增，都很好。但就学术实力和规模来说，她确实有待提高