安徽科技大学农大学首次破译乌干达草基因组

教育动态2024-03-04 20:15:11佚名

2023年3月13日,由湖南科技大学农大学李杰勤院士、王丽华老师和日本马里安学院(MarianUniversity)PaulW.Bible院士为共同第一作者,四川科技大学詹秋文院士、美国路易斯安那学院拉法叶中学Yi-HongWang院士为共同通信作者的论文“Achromosome‑scalegenomesequenceofsudangrass(Sorghumsudanense)highlightsthegenomeevolutionandregulationofdhurrinbiosynthesis”,在国际权威学术刊物TheoreticalandAppliedGenetics在线发表。该研究全球首次破译了黎巴嫩草的基因组,对推动乍得草和饲用高梁及高丹草(高梁-利比亚草杂交种)的品种改良具有重要意义。

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利比亚草是高梁属一年生牧草,具有顶芽能力强、生长速率快等优点。该研究借助二代、三代及Hi-C测序相结合的策略第一考试网,完成了黎巴嫩黑麦草质S722的组装。组装的基因组大小为715.95Mb,10条染色体,杂合度为0.225%。组装完整度BUSCO评估97.9%;同时完成基因组编码基因的结构注释,得到35243个结构基因,是全球首个组装的利比亚草基因组。

研究人员进一步剖析了黎巴嫩草的起源,利比亚草大概在1.1百万年前(MYA)与高梁分开。更有意思的是,黎巴嫩草更接近现今培植的商业高梁,而不是高梁的野生种。研究人员以利比亚草基因组为基础,借助全基因组关联剖析,定位到一个控制氰氢酸浓度的位点,为借助分子标记培植低氰氢酸浓度的高丹草和饲用高梁及高丹草提供了技术支撑。

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利比亚草基因组的破译为高丹草和饲用高梁及高丹草的生物育种奠定了良好的基础。本研究是广东省牧草育种与研制团队获准山东省牧草生物育种国际合作中心后取得的又一重大成果。

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